背景技術(shù)：

1、在典型的基于熒光的基因組測(cè)試測(cè)定中，例如，基因分型或核酸測(cè)序(使用實(shí)時(shí)、循環(huán)或逐步反應(yīng)方案)，使用激發(fā)光源激發(fā)附接到拴系在基底上的核酸分子的染料分子，在基底上的一個(gè)或多個(gè)空間定位位置中生成熒光光子信號(hào)，并且隨后通過(guò)光學(xué)系統(tǒng)將熒光成像到圖像傳感器上。然后使用分析過(guò)程來(lái)分析圖像，找到標(biāo)記分子(或克隆擴(kuò)增的分子簇)在基底上的位置，并且根據(jù)波長(zhǎng)和空間坐標(biāo)來(lái)定量熒光光子信號(hào)，然后可以將其與特定化學(xué)反應(yīng)(例如，雜交事件或堿基加成事件)在基底上的指定位置發(fā)生的程度關(guān)聯(lián)起來(lái)。基于成像的方法提供了大規(guī)模的并行性和多重復(fù)用能力，這有助于降低此類技術(shù)的成本和可訪問(wèn)性。然而，例如，由于標(biāo)記分子(或克隆擴(kuò)增的分子簇)在基底表面的小區(qū)域內(nèi)的過(guò)密堆積，或者由于圖像中的低對(duì)比度噪聲比(cnr)而引起的檢測(cè)誤差，可導(dǎo)致將熒光信號(hào)歸因于正確分子(或克隆擴(kuò)增的分子簇)的誤差。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本文公開(kāi)的方面提供了系統(tǒng)，其包括：包括彎曲表面的基底，其中所述彎曲表面包括被配置為與分析物結(jié)合的至少一個(gè)結(jié)合部分；和包括光源的光學(xué)系統(tǒng)，其中所述光源被配置為將光引導(dǎo)至所述彎曲表面，并且其中所述光被配置為探測(cè)與所述至少一個(gè)結(jié)合部分結(jié)合的所述分析物的存在或不存在。在一些實(shí)施方案中，所述分析物包括核酸。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)結(jié)合部分包括被配置為與所述核酸結(jié)合的至少一個(gè)核酸。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面是流動(dòng)池的部件。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括流動(dòng)池，其中所述流動(dòng)池包括所述彎曲表面。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面包括流動(dòng)池的毛細(xì)管。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面包括玻璃、聚合物或其組合。在一些實(shí)施方案中，所述光源被配置為以落射熒光配置探測(cè)所述彎曲表面。在一些實(shí)施方案中，所述光源被配置為以透射配置探測(cè)所述彎曲表面。在一些實(shí)施方案中，所述光源是激光器、發(fā)光二極管、鹵素?zé)艋虬谉霟?。在一些?shí)施方案中，所述光源被配置為生成具有約500納米(nm)至540nm、620nm至650nm、或460nm至500nm波長(zhǎng)的所述光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括第二彎曲表面。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括焦移組件，其被配置為在所述彎曲表面與所述第二彎曲表面之間移動(dòng)焦場(chǎng)。在一些實(shí)施方案中，所述焦移組件包括至少一個(gè)可移動(dòng)透鏡。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)可移動(dòng)透鏡布置在透鏡鏡筒內(nèi)。在一些實(shí)施方案中，所述焦移組件包括至少一個(gè)可移動(dòng)棱鏡。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面和所述第二彎曲表面是流動(dòng)池的基本上圓柱形部件的不同部分。在一些實(shí)施方案中，所述第二彎曲表面包括被配置為與第二分析物結(jié)合的至少一個(gè)第二結(jié)合部分。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)相對(duì)于所述彎曲表面是可移動(dòng)的。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)繞所述彎曲表面是可旋轉(zhuǎn)的。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)被配置為對(duì)多個(gè)結(jié)合部分進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面具有25微米(μm)的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面具有大于所述光學(xué)系統(tǒng)的焦深的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)，其中所述多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)彼此不平行。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)中的每個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)被單獨(dú)布置成與所述彎曲表面的多條切線垂直。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括臺(tái)，其中所述彎曲表面布置在所述臺(tái)上。在一些實(shí)施方案中，所述臺(tái)包括傾斜臺(tái)、旋轉(zhuǎn)臺(tái)、平移臺(tái)或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲表面包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)結(jié)合部分與所述親水性聚合物偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述親水性聚合物包括聚乙二醇(peg)、聚(乙烯醇)(pva)、聚(乙烯基吡啶)、聚(乙烯基吡咯烷酮)(pvp)、聚(丙烯酸)(paa)、聚丙烯酰胺、聚(n-異丙基丙烯酰胺)(pnipam)、聚(甲基丙烯酸甲酯)(pma)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)(phema)、聚(低聚(乙二醇)甲基醚甲基丙烯酸酯)(poegma)、聚谷氨酸(pga)、聚賴氨酸、聚葡萄糖苷、鏈霉親和素、或葡聚糖或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)具有至多約0.6的數(shù)值孔徑。在一些實(shí)施方案中，所述數(shù)值孔徑是至多約0.25。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括成像傳感器，其被配置為在所述引導(dǎo)至所述彎曲表面之后收集所述光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括被配置為加熱所述表面的加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是集成加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是紅外加熱器。

2、本文公開(kāi)的方面提供了系統(tǒng)，其包括：流動(dòng)池；和光學(xué)系統(tǒng)，所述光學(xué)系統(tǒng)包括：光源，所述光源被配置為將所述第一光引導(dǎo)至所述流動(dòng)池；濾光器，所述濾光器被配置為(i)從所述流動(dòng)池接收第二光并且(ii)傳送第三光，其中所述第三光包括所述第二光的至少一部分并且不包括所述第一光；和傳感器，所述傳感器被配置為從所述濾光器接收所述第三光。在一些實(shí)施方案中，系統(tǒng)還包括布置在所述光源與所述濾光器之間的聚焦元件組件，其中所述聚焦元件組件被配置為聚焦來(lái)自所述流動(dòng)池和所述傳感器的所述第二光。在一些實(shí)施方案中，所述聚焦元件組件包括第一聚焦元件和第二聚焦元件，其中所述第一聚焦元件沿著所述光源與所述傳感器之間的光路布置在所述濾光器與所述第二聚焦元件之間。在一些實(shí)施方案中，所述聚焦元件組件包括楔形塊組件，并且其中所述第一聚焦元件包括第一楔形件，并且所述第二聚焦元件包括第二楔形件。在一些實(shí)施方案中，所述第一楔形件和所述第二楔形件由熔融二氧化硅組成。在一些實(shí)施方案中，所述第一楔形件和所述第二楔形件具有包括約1.5的折射率。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括與所述第一楔形件耦合的壓電驅(qū)動(dòng)器。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括在所述第一楔形件與所述第二楔形件之間的間隙。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括容納所述流動(dòng)池的外殼。在一些實(shí)施方案中，所述外殼還容納在楔形塊-壓電驅(qū)動(dòng)器組件中的所述楔形塊和所述壓電驅(qū)動(dòng)器。在一些實(shí)施方案中，所述楔形塊–壓電驅(qū)動(dòng)器組件布置在所述傳感器與所述流動(dòng)池之間。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括臺(tái)。在一些實(shí)施方案中，所述臺(tái)是傾斜臺(tái)、旋轉(zhuǎn)臺(tái)、平移臺(tái)或其組合。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)還包括被配置用于初始聚焦的自動(dòng)聚焦元件。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括透鏡鏡筒。在一些實(shí)施方案中，所述自動(dòng)聚焦元件容納在所述透鏡鏡筒內(nèi)。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池包括一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面，所述內(nèi)表面具有與其偶聯(lián)的親水性聚合物層。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池還包括與所述親水性聚合物層偶聯(lián)的多種生物聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池包括第一內(nèi)表面和第二內(nèi)表面，其中所述第一內(nèi)表面布置在所述傳感器與所述第二內(nèi)表面之間。在一些實(shí)施方案中，所述第一內(nèi)表面和所述第二內(nèi)表面包括與其偶聯(lián)的生物聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述親水性聚合物層包含聚乙二醇(peg)、聚(乙烯醇)(pva)、聚(乙烯基吡啶)、聚(乙烯基吡咯烷酮)(pvp)、聚(丙烯酸)(paa)、聚丙烯酰胺、聚(n-異丙基丙烯酰胺)(pnipam)、聚(甲基丙烯酸甲酯)(pma)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)(phema)、聚(低聚(乙二醇)甲基醚甲基丙烯酸酯)(poegma)、聚谷氨酸(pga)、聚賴氨酸、聚葡萄糖苷、鏈霉親和素、或葡聚糖或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述濾光器包括多帶濾光器。在一些實(shí)施方案中，所述多帶濾光器包括三帶阻帶濾光器。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)還包括布置在所述濾光器與所述流動(dòng)池之間的成像光學(xué)器件。在一些實(shí)施方案中，所述成像光學(xué)器件具有包括1x的縮減。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)具有包括大于1毫米(mm)2的視場(chǎng)(fov)。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)具有包括小于0.6的數(shù)值孔徑(na)。在一些實(shí)施方案中，所述na包括約0.25。在一些實(shí)施方案中，所述傳感器包括多個(gè)成像傳感器，所述成像傳感器被配置為捕獲所述fov。在一些實(shí)施方案中，所述光源包括多個(gè)光源，所述多個(gè)光源包括：第一光源，其被配置為發(fā)射包括第一波長(zhǎng)范圍的所述第一光；第二光源，其被配置為發(fā)射包括第二波長(zhǎng)范圍的第二光；和第三光源，其被配置為發(fā)射包括第三波長(zhǎng)范圍的第三光，其中所述第一波長(zhǎng)范圍、所述第二波長(zhǎng)范圍和所述第三波長(zhǎng)范圍是不同的波長(zhǎng)范圍。在一些實(shí)施方案中，由所述第一光源的所述第一波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第一熒光團(tuán)不同于由所述第二光源的所述第二波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第二熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，由所述第一光源的所述第一波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第一熒光團(tuán)不同于由所述第二光源的所述第二波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第二熒光團(tuán)；并且由所述第二光源的所述第二波長(zhǎng)范圍激發(fā)的所述第二熒光團(tuán)不同于由所述第三光源的所述第三波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第三熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，由所述第三光源的所述第三波長(zhǎng)范圍激發(fā)的第三熒光團(tuán)不同于由所述第一光源的所述第一波長(zhǎng)范圍激發(fā)的所述第一熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，所述第一光源的所述第一波長(zhǎng)范圍包括在約500至約540納米(nm)之間。在一些實(shí)施方案中，所述第二光源的所述第二波長(zhǎng)范圍包括在約620至約640nm之間。在一些實(shí)施方案中，所述第三光源的所述第三波長(zhǎng)范圍包括在約460至約500nm之間。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池包括內(nèi)表面，所述內(nèi)表面包括多個(gè)離散區(qū)域，其中(i)所述多個(gè)離散區(qū)域中的第一離散區(qū)域包括在所述第一離散區(qū)域處與所述內(nèi)表面偶聯(lián)的第一組的核酸分子，并且(ii)所述多個(gè)離散區(qū)域中的第二離散區(qū)域包括在所述第二離散區(qū)處與所述內(nèi)表面偶聯(lián)的第二組的所述核酸分子，其中所述第一組的所述核酸分子不同于所述第二組的所述核酸分子。在一些實(shí)施方案中，所述第一組的所述核酸分子包含與其偶聯(lián)的第一熒光團(tuán)，并且所述第二組的所述核酸分子包含與其偶聯(lián)的第二熒光團(tuán)，其中所述第一熒光團(tuán)不同于所述第二熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)離散區(qū)域中的第三離散區(qū)域包括在所述第三離散區(qū)域處與所述內(nèi)表面偶聯(lián)的第三組的所述核酸分子，并且其中所述第三組的所述核酸分子不同于所述第一組和所述第二組的所述核酸分子。在一些實(shí)施方案中，所述第三組的所述核酸分子包含與其偶聯(lián)的第三熒光團(tuán)，其中所述第三熒光團(tuán)不同于第二第一熒光團(tuán)和所述第二熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)離散區(qū)域中的第四離散區(qū)域包括在所述第四離散區(qū)域處與所述內(nèi)表面偶聯(lián)的第四組的核酸分子，并且其中所述第四組的核酸分子包含所述第一熒光團(tuán)和所述第三熒光團(tuán)，其中所述第一熒光團(tuán)不同于所述第三熒光團(tuán)。在一些實(shí)施方案中，所述光源包括發(fā)光二極管(led)光源。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)還包括光傳輸部件。在一些實(shí)施方案中，所述光傳輸部件包括波導(dǎo)、光管、光纖或其組合。在一些實(shí)施方案中，所述光源包括固態(tài)光源。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是集成加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述集成加熱器是透明加熱器塊集成加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是紅外(ir)加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)不包括二向色元件。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)不包括鏡筒透鏡。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)不包括校正光學(xué)元件，所述校正光學(xué)元件被配置為移入和移出在所述流動(dòng)池與所述多個(gè)成像傳感器之間的所述光路。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)不包括激光器。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)不包括以下的任何組合：二向色元件；鏡筒透鏡；校正光學(xué)元件，所述校正光學(xué)元件被配置為移入和移出在所述流動(dòng)池與所述傳感器之間的所述光路；激光器。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池布置在所述光源與所述傳感器之間。

3、本文公開(kāi)的方面提供了系統(tǒng)，其包括：被配置為照射樣品的光源；被配置為獲得被照射的所述樣品的圖像的傳感器；和沿著所述光源與所述傳感器之間的光路永久布置的聚焦元件，其中聚焦元件組件包括：外殼；第一聚焦元件；和第二聚焦元件，其中所述第一聚焦元件被配置為在所述外殼內(nèi)相對(duì)于所述第二聚焦元件移動(dòng)，而不相對(duì)于所述光路移動(dòng)所述外殼。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括多個(gè)所述光源，其中所述多個(gè)光源中的每個(gè)光源發(fā)射具有不同波長(zhǎng)的光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括多個(gè)所述傳感器，其中所述多個(gè)所述傳感器中的每個(gè)傳感器被配置為在不同時(shí)間獲得所述樣品的所述圖像。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括沿著所述光源與所述傳感器之間的所述光路布置的濾光器，其中所述濾光器被配置為從所述樣品接收光并將另一個(gè)光傳送至所述傳感器。在一些實(shí)施方案中，所述濾光器包括多帶濾光器。在一些實(shí)施方案中，所述多帶濾光器包括三帶阻帶濾光器。在一些實(shí)施方案中，所述第一透鏡在所述光路中被放置在所述第二透鏡之前。在一些實(shí)施方案中，所述第一透鏡在所述光路中被放置在所述第二透鏡之后。在一些實(shí)施方案中，所述樣品與流動(dòng)池的一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述樣品與所述流動(dòng)池的所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面共價(jià)偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述樣品與流動(dòng)池的兩個(gè)或更多個(gè)內(nèi)表面偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述樣品與所述流動(dòng)池的所述兩個(gè)或更多個(gè)內(nèi)表面共價(jià)偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述流動(dòng)池的所述兩個(gè)或更多個(gè)內(nèi)表面包括第一內(nèi)表面和第二內(nèi)表面，并且其中所述第一內(nèi)表面沿著在所述光源與所述第二內(nèi)表面之間的所述光路布置。在一些實(shí)施方案中，所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物層。在一些實(shí)施方案中，所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物層。在一些實(shí)施方案中，所述樣品包含與所述親水性聚合物層偶聯(lián)的多種生物聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述親水性聚合物層包含聚乙二醇(peg)、聚(乙烯醇)(pva)、聚(乙烯基吡啶)、聚(乙烯基吡咯烷酮)(pvp)、聚(丙烯酸)(paa)、聚丙烯酰胺、聚(n-異丙基丙烯酰胺)(pnipam)、聚(甲基丙烯酸甲酯)(pma)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)(phema)、聚(低聚(乙二醇)甲基醚甲基丙烯酸酯)(poegma)、聚谷氨酸(pga)、聚賴氨酸、聚葡萄糖苷、鏈霉親和素、或葡聚糖或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)具有包括大于1毫米(mm)2的視場(chǎng)(fov)。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)具有包括小于0.6的數(shù)值孔徑(na)。在一些實(shí)施方案中，所述na包括約0.25。在一些實(shí)施方案中，所述傳感器包括多個(gè)成像傳感器，所述成像傳感器被配置為捕獲所述fov。在一些實(shí)施方案中，所述聚焦元件組件包括楔形塊組件，并且其中所述第一聚焦元件包括第一楔形件，并且所述第二聚焦元件包括第二楔形件。在一些實(shí)施方案中，所述第一楔形件和所述第二楔形件由熔融二氧化硅組成。在一些實(shí)施方案中，所述第一楔形件和所述第二楔形件具有包括約1.5的折射率。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括在所述第一聚焦元件與所述第二聚焦元件之間的間隙。

4、本文公開(kāi)的方面提供了對(duì)樣品進(jìn)行成像的方法，所述方法包括：提供本文所述的所述系統(tǒng)；用來(lái)自所述光源的所述光照射所述樣品，其中所述樣品與所述流動(dòng)池的一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面偶聯(lián)；通過(guò)從與所述流動(dòng)池的所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面偶聯(lián)的所述樣品接收所述第二光并將第三光傳送至所述傳感器，由所述濾光器過(guò)濾所述第二光；以及用所述傳感器獲得所述樣品的圖像。在一些實(shí)施方案中，所述樣品包含生物聚合物，其中所述生物聚合物的第一子集與所述流動(dòng)池的所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面的第一內(nèi)表面偶聯(lián)，并且所述生物聚合物的第二子集與所述流動(dòng)池的所述一個(gè)或多個(gè)內(nèi)表面的第二內(nèi)表面偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述用所述傳感器獲得所述樣品的所述圖像包括對(duì)所述流動(dòng)池的所述第一內(nèi)表面和所述第二內(nèi)表面進(jìn)行成像。

5、本文公開(kāi)的方面提供了對(duì)樣品進(jìn)行成像的方法，所述方法包括：提供本文公開(kāi)的所述系統(tǒng)；通過(guò)所述光源照射所述樣品；用所述聚焦元件組件聚焦從所述樣品發(fā)射的光；以及接收來(lái)自(c)的所述光并通過(guò)所述傳感器獲得所述樣品的圖像。在一些實(shí)施方案中，所述樣品包含生物聚合物，其中所述生物聚合物的第一子集與流動(dòng)池的第一內(nèi)表面偶聯(lián)，并且所述生物聚合物的第二子集與流動(dòng)池的第二內(nèi)表面偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述用所述傳感器獲得所述樣品的所述圖像包括對(duì)所述流動(dòng)池的所述第一內(nèi)表面和所述第二內(nèi)表面進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述第一內(nèi)表面和所述第二內(nèi)表面包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物層。在一些實(shí)施方案中，所述通過(guò)所述傳感器獲得所述樣品的所述圖像包括對(duì)大于4mm2的視場(chǎng)(fov)進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括對(duì)所述樣品進(jìn)行測(cè)序。在一些實(shí)施方案中，所述測(cè)序包括進(jìn)行結(jié)合測(cè)序(sequencing-by-binding)或合成測(cè)序(sequencing-by-synthesis)。在一些實(shí)施方案中，所述測(cè)序包括：提供可檢測(cè)核苷酸綴合物，所述可檢測(cè)核苷酸綴合物包含(i)共同核心、(ii)多個(gè)標(biāo)記和(iii)與所述共同核心偶聯(lián)的多個(gè)核苷酸；在防止所述多個(gè)核苷酸的核苷酸與多個(gè)引發(fā)的核酸序列的互補(bǔ)核苷酸之間形成磷酸二酯鍵的條件下，使所述樣品的所述多個(gè)引發(fā)的核酸序列與所述可檢測(cè)核苷酸綴合物接觸，其中所述第一多個(gè)核苷酸的所述核苷酸與所述多個(gè)引發(fā)的核酸序列的引發(fā)的核酸序列中的所述互補(bǔ)核苷酸穩(wěn)定偶聯(lián)；檢測(cè)來(lái)自所述可檢測(cè)核苷酸綴合物的所述多個(gè)標(biāo)記的信號(hào)，從而鑒定所述引發(fā)的核酸序列的所述互補(bǔ)核苷酸；以及用不同的可檢測(cè)核苷酸綴合物進(jìn)行(a)至(c)以檢測(cè)第二信號(hào)，從而鑒定所述引發(fā)的核酸序列中的另一個(gè)互補(bǔ)核苷酸。

6、在一方面，本公開(kāi)提供了一種系統(tǒng)，其包括：彎曲基底，其中所述彎曲基底包括被配置為與分析物結(jié)合的至少一個(gè)結(jié)合部分；和包括光源的光學(xué)系統(tǒng)，其中所述光源被配置為將來(lái)自所述光源的光引導(dǎo)至所述彎曲基底，并且其中所述光被配置為探測(cè)與所述彎曲基底結(jié)合的所述分析物的存在或不存在。

7、在一些實(shí)施方案中，所述分析物包括核酸。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)結(jié)合部分包括被配置為與所述核酸結(jié)合的至少一個(gè)核酸。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底是流動(dòng)池的部件。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括流動(dòng)池，其中所述流動(dòng)池包括所述彎曲基底。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底包括流動(dòng)池的毛細(xì)管。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底包括玻璃、聚合物或其組合。在一些實(shí)施方案中，所述光源被配置為以落射熒光配置探測(cè)所述彎曲基底。在一些實(shí)施方案中，所述光源被配置為以透射配置探測(cè)所述彎曲基底。在一些實(shí)施方案中，所述光源是激光器、發(fā)光二極管、鹵素?zé)艋虬谉霟?。在一些?shí)施方案中，所述光源被配置為生成具有約500納米(nm)至540nm、620nm至650nm、或460nm至500nm波長(zhǎng)的所述光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括第二彎曲基底。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括焦移組件，其被配置為在所述彎曲基底與所述第二彎曲基底之間移動(dòng)焦場(chǎng)。在一些實(shí)施方案中，所述焦移組件包括至少一個(gè)可移動(dòng)透鏡。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)可移動(dòng)透鏡布置在透鏡鏡筒內(nèi)。在一些實(shí)施方案中，所述焦移組件包括至少一個(gè)可移動(dòng)棱鏡。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底和所述第二彎曲基底是流動(dòng)池的基本上圓柱形部件的不同部分。在一些實(shí)施方案中，所述第二彎曲基底包括被配置為與第二分析物結(jié)合的至少一個(gè)第二結(jié)合部分。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)相對(duì)于所述彎曲基底是可移動(dòng)的。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)繞所述彎曲基底是可旋轉(zhuǎn)的。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)被配置為對(duì)多個(gè)結(jié)合部分進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底具有25微米(μm)的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底具有大于所述光學(xué)系統(tǒng)的焦深的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)，其中所述多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)彼此不平行。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)中的每個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)被單獨(dú)布置成與所述彎曲基底的多條切線垂直。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括臺(tái)，其中所述彎曲基底布置在所述臺(tái)上。在一些實(shí)施方案中，所述臺(tái)包括傾斜臺(tái)、旋轉(zhuǎn)臺(tái)、平移臺(tái)或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)結(jié)合部分與所述親水性聚合物偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述親水性聚合物包括聚乙二醇(peg)、聚(乙烯醇)(pva)、聚(乙烯基吡啶)、聚(乙烯基吡咯烷酮)(pvp)、聚(丙烯酸)(paa)、聚丙烯酰胺、聚(n-異丙基丙烯酰胺)(pnipam)、聚(甲基丙烯酸甲酯)(pma)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)(phema)、聚(低聚(乙二醇)甲基醚甲基丙烯酸酯)(poegma)、聚谷氨酸(pga)、聚賴氨酸、聚葡萄糖苷、鏈霉親和素、或葡聚糖或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)具有至多約0.6的數(shù)值孔徑。在一些實(shí)施方案中，所述數(shù)值孔徑是至多約0.25。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括成像傳感器，其被配置為在所述引導(dǎo)至所述彎曲基底之后收集所述光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括被配置為加熱所述基底的加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是集成加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是紅外加熱器。

8、在另一方面，本公開(kāi)提供了一種系統(tǒng)，其包括：彎曲基底；和包括光源的光學(xué)系統(tǒng)，其中所述光源被配置為將來(lái)自所述光源的光引導(dǎo)至所述彎曲基底。

9、在另一方面，本公開(kāi)提供了一種系統(tǒng)，其包括：基底；和光學(xué)系統(tǒng)，其中所述光學(xué)系統(tǒng)被配置為對(duì)所述基底的至少約5平方毫米(mm2)的區(qū)域進(jìn)行成像。

10、在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)被配置為同時(shí)對(duì)所述區(qū)域進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)包括多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)子光學(xué)系統(tǒng)被配置為平行地對(duì)所述基底的所述區(qū)域進(jìn)行成像。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)包括被配置為提供光束的光源和透鏡，其中所述透鏡被配置為將來(lái)自所述光源的光束聚焦到包括所述區(qū)域的所述基底的聚焦區(qū)域上。在一些實(shí)施方案中，所述光束在所述聚焦區(qū)域上的均勻性為至少約90％。在一些實(shí)施方案中，所述基底基底的所述區(qū)域被布置為中空?qǐng)A柱體。在一些實(shí)施方案中，所述基底是毛細(xì)管流動(dòng)池的至少一部分。在一些實(shí)施方案中，所述毛細(xì)管流動(dòng)池包括固體核心。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括臺(tái)，其中所述基底布置在所述臺(tái)上。在一些實(shí)施方案中，所述臺(tái)包括傾斜臺(tái)、旋轉(zhuǎn)臺(tái)、平移臺(tái)或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述基底包括與其偶聯(lián)的親水性聚合物。在一些實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)結(jié)合部分與所述親水性聚合物偶聯(lián)。在一些實(shí)施方案中，所述親水性聚合物包括聚乙二醇(peg)、聚(乙烯醇)(pva)、聚(乙烯基吡啶)、聚(乙烯基吡咯烷酮)(pvp)、聚(丙烯酸)(paa)、聚丙烯酰胺、聚(n-異丙基丙烯酰胺)(pnipam)、聚(甲基丙烯酸甲酯)(pma)、聚(甲基丙烯酸2-羥乙酯)(phema)、聚(低聚(乙二醇)甲基醚甲基丙烯酸酯)(poegma)、聚谷氨酸(pga)、聚賴氨酸、聚葡萄糖苷、鏈霉親和素、或葡聚糖或其任何組合。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)具有至多約0.6的數(shù)值孔徑。在一些實(shí)施方案中，所述數(shù)值孔徑是至多約0.25。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括成像傳感器，其被配置為在所述引導(dǎo)至所述基底之后收集所述光。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)還包括被配置為加熱所述基底的加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是集成加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述加熱器是紅外加熱器。在一些實(shí)施方案中，所述基底是彎曲基底。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底具有25微米(μm)的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述彎曲基底具有大于所述光學(xué)系統(tǒng)的焦深的平坦度偏差。在一些實(shí)施方案中，所述光學(xué)系統(tǒng)被配置為以約1μm或更小的分辨率對(duì)所述基底的所述區(qū)域進(jìn)行成像。

11、援引并入

12、本說(shuō)明書(shū)中提及的所有出版物、專利以及專利申請(qǐng)通過(guò)引用全文并入本文，其程度如同每個(gè)單獨(dú)的出版物、專利或?qū)＠暾?qǐng)被專門地并且單獨(dú)地指示通過(guò)引用全文并入。如果本文中的術(shù)語(yǔ)與并入的參考文獻(xiàn)中的術(shù)語(yǔ)之間存在沖突，則以本文中的術(shù)語(yǔ)為準(zhǔn)。