一種基于線粒體coi基因檢測(cè)華支睪吸蟲(chóng)囊蚴的pcr擴(kuò)增試劑盒及擴(kuò)增引物的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及寄生蟲(chóng)檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種基于線粒體C0I基因檢測(cè)華支睪 吸蟲(chóng)囊蝴的PCR擴(kuò)增試劑盒及擴(kuò)增引物。
【背景技術(shù)】
[0002] 華支睪吸蟲(chóng)?。–lonorchiasis)是由于感染華支睪吸蟲(chóng)(Clonorchis sinensis, Cs)引起的食源性人獸共患寄生蟲(chóng)病,嚴(yán)重危害人類(lèi)的健康。該病主要分布在東亞、東南亞 和東歐的部分國(guó)家,如中國(guó)、韓國(guó)、老撾和越南等。據(jù)統(tǒng)計(jì)全球約有3500萬(wàn)人感染這種吸 蟲(chóng),其中1500萬(wàn)人分布在我國(guó)的各個(gè)省市區(qū)(除內(nèi)蒙古、青海、西藏和新疆外均有發(fā)現(xiàn)), 以廣東、廣西和東北三省尤為嚴(yán)重。目前,華支睪吸蟲(chóng)的鑒定方法還沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),目前 對(duì)華支睪吸蟲(chóng)囊蝴的診斷依賴于顯微鏡檢查。眾所周知,顯微鏡檢查耗費(fèi)時(shí)間長(zhǎng),檢查效率 低,對(duì)檢查者臨床工作經(jīng)驗(yàn)要求較高,而且對(duì)于與華支睪吸蟲(chóng)親緣關(guān)系相近的囊蝴,蟲(chóng)卵形 態(tài)相似,普通光鏡無(wú)法區(qū)分,使用這種方法往往會(huì)出現(xiàn)誤判。免疫診斷法雖然較顯微鏡檢查 法效率高,但也常常為靈敏度和特異性所局限。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0003] 本發(fā)明的目的在于提供一種基于線粒體C0I基因檢測(cè)華支睪吸蟲(chóng)囊蝴的PCR擴(kuò)增 試劑盒,靈敏度高,特異性強(qiáng),檢測(cè)快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲(chóng)感染的診治和預(yù)防提供有效的 技術(shù)手段。
[0004] 本發(fā)明還提供了一種基于線粒體C0I基因檢測(cè)華支睪吸蟲(chóng)囊蝴的擴(kuò)增引物,特異 性強(qiáng)。
[0005] 本發(fā)明解決其技術(shù)問(wèn)題所采用的技術(shù)方案是:
[0006] -種基于線粒體C0I基因檢測(cè)華支睪吸蟲(chóng)囊蝴的PCR擴(kuò)增試劑盒,包括PCR擴(kuò)增 反應(yīng)液,所述 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)液包括:Tris-HCl 10mmol/L, KC150mmol/L, MgCl2l. 5mmol/L, dNTPs 0? 8mmol/L,正向引物 0? 4 y mol/L,反向引物 0? 4 y mol/L,DNA 模板 20ng/ y L,Taq 酶 0. 075U/yL〇
[0007] 本發(fā)明以華支睪吸蟲(chóng)線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基1 (C0I)基因?yàn)槟繕?biāo),專門(mén)設(shè)計(jì) 了針對(duì)性的特異性引物,進(jìn)一步的設(shè)計(jì)了檢測(cè)試劑盒,檢測(cè)結(jié)果特異,結(jié)果易判斷,靈敏度 高,特異性強(qiáng),檢測(cè)快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲(chóng)感染的診治和預(yù)防提供有效的技術(shù)手段。
[0008] 作為優(yōu)選,所述正向引物序列為:5' -GAGITCCAGCAAGCATATATAATC-3'(SEQID NO. 1) 〇
[0009] 作為優(yōu)選,所述反向引物序列為:5'-GTCACAITTGTACTACTTTAACAGGTA-3'(SEQ ID NO. 2) 〇
[0010] 作為優(yōu)選,所述Tris-HCl的pH為8. 3。
[0011] -種基于線粒體C0I基因檢測(cè)華支睪吸蟲(chóng)囊蝴的擴(kuò)增引物所述擴(kuò)增引物包括 正向引物和反向引物,所述正向引物序列為:5' -GAGTTCCAGCAAGCATATATAATC-3'(SEQ ID NO. 1),所述反向引物序列為:5'-GTCACAITTGTACTACTTTAACAGGTA-3'(SEQ ID NO. 2)。采用 本發(fā)明設(shè)計(jì)的特異性擴(kuò)增引物,檢測(cè)靈敏度高,特異性強(qiáng)。
[0012] 本發(fā)明的有益效果是:靈敏度高,特異性強(qiáng),檢測(cè)快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲(chóng)感染的 診治和預(yù)防提供有效的技術(shù)手段。
【附圖說(shuō)明】
[0013] 圖1是本發(fā)明試劑盒對(duì)華支睪吸蟲(chóng)DNA的PCR擴(kuò)增結(jié)果圖,
[0014] 圖中:M :100bp DNA marker,1-2:目的擴(kuò)增條帶。
[0015] 圖2是本發(fā)明試劑盒的特異性試驗(yàn)結(jié)果圖,
[0016] 圖中:M:100bpDNAmarker;1:目的擴(kuò)增條帶;2-4:簡(jiǎn)單異尖線蟲(chóng)、刺激隱核蟲(chóng)和 棘顎口線蟲(chóng)。
[0017] 圖3是本發(fā)明試劑盒的敏感性試驗(yàn)結(jié)果圖,
[0018] 圖中:M :100bp DNA Marker ;1 :40ng/ y L華支睪吸蟲(chóng) DNA ;2 :4ng/ y L 華支睪吸蟲(chóng) DNA ;3 :400pg/ y L華支睪吸蟲(chóng)DNA ;4 :40pg/ y L華支睪吸蟲(chóng)DNA ;5 :4pg/ y L華支睪吸蟲(chóng) DNA ;6 :0? 4pg/ y L 華支睪吸蟲(chóng) DNA。
【具體實(shí)施方式】
[0019] 下面通過(guò)具體實(shí)施例,并結(jié)合附圖,對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案作進(jìn)一步的具體說(shuō)明。
[0020] 本發(fā)明中,若非特指,所采用的原料和設(shè)備等均可從市場(chǎng)購(gòu)得或是本領(lǐng)域常用的。 下述實(shí)施例中的方法,如無(wú)特別說(shuō)明,均為本領(lǐng)域的常規(guī)方法。
[0021] 本發(fā)明實(shí)施如下:
[0022] 1、材料與方法
[0023] 1. 1 材料:
[0024] 囊蝴和華支睪吸蟲(chóng)DNA陽(yáng)性對(duì)照來(lái)源:2013年5月底采集舟山市場(chǎng)上銷(xiāo)售的麥穗 魚(yú),用消化法從魚(yú)肉組織中分離獲得華支睪吸蟲(chóng)囊蝴。華支睪吸蟲(chóng)DNA陽(yáng)性對(duì)照品由舟山 出入境檢驗(yàn)檢疫局提供。簡(jiǎn)單異尖線蟲(chóng)、刺激隱核蟲(chóng)和棘顎口線蟲(chóng)由舟山出入境檢驗(yàn)檢疫 局提供。
[0025] dNTPs、Taq酶均購(gòu)自大連寶生物公司。
[0026] 1. 2 方法
[0027] 1. 2. 1囊蝴的分離
[0028]將麥穗魚(yú)用清水洗凈,去除魚(yú)頭、魚(yú)尾、魚(yú)鰭、魚(yú)刺及內(nèi)臟,將魚(yú)肉用絞肉機(jī)加工 成肉泥,放入玻璃杯。按每克魚(yú)肉加入10mL人工胃液(鹽酸濃度為8mL/L,胃蛋白酶濃 度8g/L,氯化鈉濃度為9g/L),37°C孵箱作用2h,將消化完全的魚(yú)肉消化液經(jīng)80目分離篩 過(guò)濾集中于2L的分液漏斗中沉淀0. 5h,放出約300mL的消化液至500mL的燒杯中,沉淀 10-30min后,棄去上面的濁液,用清水反復(fù)清洗至液體清亮,隨后將含蟲(chóng)體的液體轉(zhuǎn)移至 15mL尖底離心管內(nèi),沉淀lmin后將含囊蝴的上清液體吸至另一新管內(nèi),反復(fù)沉淀幾次,顯 微鏡下檢查囊蝴純凈度。將剩余的囊蝴保存在Alsever' s溶液(Alsever's Solution,市 售)中,置于4°C冰箱備用。
[0029] 1.2. 2囊蝴的形態(tài)學(xué)和DNA提取
[0030] 取少量上述收集到的囊蝴置于顯微鏡下觀察,并對(duì)其進(jìn)行了形態(tài)學(xué)鑒定。隨后按 照Takara universal Genomic DNA Extraction kit (市售,購(gòu)自大連寶生物公司)說(shuō)明書(shū) 中提供的方法提取囊蝴的基因組DNA。
[0031] 1. 2. 3引物設(shè)計(jì)與合成
[0032] 針對(duì)華支睪吸蟲(chóng)線粒體C0I基因(GenBank:AF096229)序列設(shè)計(jì)特異性引物1對(duì): 正向引物序列為:5'-GAGITCCAGCAAGCATATATAATC-3'(SEQ ID N0. 1),反向引物序列為:5'_
[0033] GTCACAITTGTACTACTTTAACAGGTA-3'(SEQ ID N0. 2)。引物設(shè)計(jì)采用 DNASTAR5. 0 軟 件程序設(shè)計(jì)完成,由生工生物(上海)有限公司合成,對(duì)上述2. 2提取的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增, 獲得228kb目標(biāo)產(chǎn)物。
[0034] 1. 2. 4目的基因擴(kuò)增與序列測(cè)定
[0035] 20yL的PCR反應(yīng)體系中組分如下:
[0036] pH8. 3 的 Tris-HCl 10mmol/L,KC1 50mmol/L,MgCl2l. 5mmol/L,dNTPsO. 8mmol/L, 正向引物(SEQ ID NO. 1)0.4 y