本發(fā)明屬于生物基因工程技術領域,具體涉及一種催化丙氨酸脫羧的蛋白質(zhì)及其基因和應用。
背景技術:
茶氨酸(L-Theanine)是茶葉中特有的游離氨基酸,茶氨酸是谷氨酸γ-乙基酰胺,有甜味。茶葉中含有大量的茶氨酸,是形成茶葉風味的主要成分。茶氨酸含量通常占茶葉中其他氨基酸總量的50%以上。
研究發(fā)現(xiàn)茶氨酸合成受到前提物質(zhì)乙胺的調(diào)控。在植物組織培養(yǎng)合成茶氨酸的研究中,有學者已經(jīng)證實向培養(yǎng)基中添加前體物質(zhì)-鹽酸乙胺時,可以大幅度提高愈傷組織中的茶氨酸合成量,而直接添加丙氨酸,則對茶氨酸累積影響不大。茶氨酸合成中的乙胺系由丙氨酸脫羧(CsAlaDC)而來,催化該反應即為丙氨酸脫羧酶。該酶在子葉和根中活性高,在綠色幼苗根中活性高于黃化幼苗,預示著它積極參與茶氨酸合成中所需乙胺的形成。
目前,有關CsAlaDC基因的克隆鑒定未見任何報道。鑒于乙胺的添加可以極大提高茶樹愈傷組織和懸浮細胞合成茶氨酸,因此CsAlaDC基因的發(fā)現(xiàn)對于研究茶樹氮吸收與轉(zhuǎn)運機制具有重要的意義。
技術實現(xiàn)要素:
針對現(xiàn)有技術存在的問題,本發(fā)明的目的在于設計提供一種茶樹特有丙氨酸脫羧蛋白CsAlaDC及其編碼基因和應用的技術方案。
所述的一種催化丙氨酸脫羧的蛋白質(zhì),其特征在于該蛋白質(zhì)的氨基酸序列為:
1)SEQ ID No.2 所示的氨基酸序列 ;或
2)SEQ ID No.2 所示的氨基酸序列經(jīng)替換、缺失和/或添加一個或幾個氨基酸殘基形成的具有同等功能的氨基酸序列。
所述編碼所述蛋白質(zhì)的基因,其特征在于該基因的核苷酸序列為:
1)SEQ ID No.1 所示的核苷酸;或
2)SEQ ID No.1 所示的核苷酸序列經(jīng)取代一個或幾個核苷酸,得到編碼 CsAlaDC的核苷酸序列。
所述編碼基因的重組載體。
所述的編碼基因在催化丙氨酸脫羧形成乙胺中的應用。
所述的編碼基因在調(diào)控茶樹茶氨酸合成中的應用。
所述的一種催化丙氨酸脫羧形成乙胺的方法,其特征在于包括如下步驟:將編碼基因?qū)氪竽c桿菌中,誘導表達得到重組蛋白,將重組蛋白純化后與丙氨酸溶液混合進行催化得到乙胺,所述的編碼基因的核苷酸序列為:
1)SEQ ID No.1 所示的核苷酸;或
2)SEQ ID No.1 所示的核苷酸序列經(jīng)取代一個或幾個核苷酸,得到編碼 CsAlaDC的核苷酸序列。
所述的一種催化丙氨酸脫羧形成乙胺的方法,其特征在于丙氨酸脫羧酶的催化反應的條件為10mM 丙氨酸, 100mM的磷酸鉀緩沖液,0.08-0.12 mM 磷酸吡哆醛,5mM二硫蘇糖醇,1mM K2EDTA,10%的甘油,反應溶液pH 為:pH 7.2-pH 7.8反應溫度為35℃-45℃。
本發(fā)明的實驗證明,本發(fā)明在茶樹中發(fā)現(xiàn)丙氨酸脫羧酶蛋白CsAlaDC,將該蛋白對應的基因在大腸桿菌中過表達,純化的重組蛋白同時具有催化丙氨酸脫羧的活性,驗證了該基因具有催化丙氨酸脫羧的功能。
附圖說明
圖1 丙氨酸脫酸酶催化反應圖示;
圖2 茶樹CsAlaDC的基因序列;
圖3 不同組織CsAlaDC基因qPCR相對定量結(jié)果;
圖4 CsAlaDC蛋白原核純化的SDS-PAGE;
圖5 重組CsAlaDC蛋白催化丙氨酸脫羧形成乙胺的高效液相(HPLC)檢測圖譜;
圖6 催化反應2h與24h后,反應液中生成乙胺的濃度。
具體實施方式
以下結(jié)合實施例來進一步說明本發(fā)明。
實施例
(1) 基因克?。阂札埦?3的幼根為材料,用試劑盒法提取總RNA;根據(jù)CsAlaDC的mRNA序列設計引物,用反轉(zhuǎn)錄PCR法獲得該基因的全長,并測序驗證。反轉(zhuǎn)錄基因克隆所采用的引物為SDC-RT-F1: 5′- CTCCTCGGATTCTCAAACCTC AC-3′;SDC-RT-R: 5′- CACACAAACGATAGTAGAACCAACA-3′。
(2)實時熒光定量分析: 熒光定量PCR采用ABI 7500實時PCR系統(tǒng)(Applied Biosystems),以SYBR Green染料進行標記。內(nèi)參基因選擇茶樹GAPDH基因(GE651107)。采用的引物為SDC-QRT-F: 5′-GGGAAGAACGTGCACACAAC-3′; SDC-QRT-R: 5′-CTAACCAAGACACCGGCCAT-3′; GAPDH-F:5′-TTGGCATCGTTGAGGG TCT-3′及 GAPDH-R:5′-CAGTGGGAACACGGAAAGC-3′。反應體系為25ml,包含0.5mL LATaq, 5mL PCR緩沖液, 2 mL dNTP(2.5 mM), 0.5mL引物(10 M), 1mL cDNA(40 ng)和15.5mL ddH2O。 反應條件為: 94℃,3分鐘; 95℃ ,30秒;59℃,30秒;72℃,1分鐘;30個循環(huán)。72℃,10分鐘;4℃保存。每組樣品3個重復。如圖3所示,三個茶樹品種中根、成熟葉片、一芽二葉等不同組織部位CsAlaDC基因qPCR相對定量結(jié)果,說明茶樹CsAlaDC基因在茶樹根中特異表達。茶樹CsAlaDC的基因序列如圖2所示。茶樹CsAlaDC的基因序列如SEQ ID No.1 所示,其編碼的蛋白質(zhì)氨基酸序列如SEQ ID No.2 所示。
(3)轉(zhuǎn)基因蛋白重組表達純化:將茶樹CsAlaDC全長cDNA的編碼框克隆到含有T7啟動子的原核表達載體pET28b上。具體步驟包括:設計特異引物:正向引物5’-CGGGATCC(BamH I)ATGGAAGGGACTGTGTCAGTGCTATC and reverse primer 5’-CCCAAGCTT(Hind III)GTTTATGAAGATCACAATCACAATT CTCAC;表達載體構(gòu)建:PCR 擴增的CsAlaDC基因經(jīng)酚、酚/氯仿(1:1)、氯仿/異戊醇(24:1)抽提純化后,用BamH I 和Hind III 雙酶切,低熔點膠電泳分離回收1 500 bp左右的片斷。再將回收片段與經(jīng)相同雙酶切的表達載體pET-28b 連接,從而將CsAlaDC基因定向克隆到表達載體pET-28b 中,并將含有插入片斷的重組質(zhì)粒命名為pET-AlaDC,將重組質(zhì)粒pET-AlaDC 轉(zhuǎn)化到E.coli BL21 中,構(gòu)建工程菌;IPTG誘導大腸表達及蛋白純化:挑取經(jīng)DNA 測序驗證的工程菌的單菌落,接入5 ml 含氨芐青霉素(50μg/ml)的LB 培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)過夜,取50μl 接入5 ml 含氨芐青霉素(50μg/ml)的LB 培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)2 h 左右,加入IPTG 至終濃度0.05 mmol/L,于16-22℃誘導表達12-18 h,室溫5 000 r/min 離心5 min收集菌體。菌體破碎后,用鎳柱親和層析純化重組蛋白,洗脫液為160mM 咪唑,透析液為25mM Tris-HCl(pH 7.4),150mM NaCl,10%甘油。如圖4所示,CsAlaDC蛋白原核純化的聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)圖。
(4)丙氨酸脫羧活性驗證
將10μL純酶液加到90μL反應緩沖液A中(10mM 丙氨酸, 100mM pH 7.2-pH 7.8的磷酸鉀緩沖液,0.08-0.12 mM 磷酸吡哆醛,5mM二硫蘇糖醇,1mM K2EDTA,10%的甘油),混勻后,于35℃-45℃水浴2h和24h,分別取45μL反應液于新的離心管中,加5μL 10%的三氯乙酸停止反應,靜置5min后,加入400μL超純水稀釋,按照Waters AccQ Tag氨基酸分析包中的方法進行衍生,高效液相色譜儀檢測產(chǎn)物含量。其中丙氨酸脫酸酶催化反應如圖1所示。HPLC檢測發(fā)現(xiàn),催化反應2h時檢測到乙胺,催化反應24h時,乙胺大量累積(增加了6倍),說明該重組蛋白具有催化丙氨酸脫羧形成乙胺的能力(圖5;圖6)。
SEQUENCE LISTING
<110> 中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所
<120> 一種催化丙氨酸脫羧的蛋白質(zhì)及其基因和應用
<130> 11
<160> 2
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1437
<212> DNA
<213> 茶樹
<400> 1
atggaaggga ctgtgtcagt gctatcgaat gtgagcaagg tggagctgtt gtcgaagtgc 60
tttgatctca ttaccatccc tgtggaaccc ttgcctccgg ttgtggcttc caacggagtt 120
gctggcggag agacgaagaa gatgaaggag aaggatattg ttctggggaa gaacgtgcac 180
acaacaagcc tcaccatcac ggagcctgat gtggacgatg actccaccag cgatatggag 240
gccttcatgg ccggtgtctt ggttaggtat cgcaaaactc tcattgagaa gaccaagtat 300
catttaggct atccatttaa tctggacttg gattatggtc ctctagcgga attgcagcat 360
ttcgccataa acaaccttgg cgatccattt attgaaagca actatggtgt tcattcaaga 420
caatttgaag tgggtgtttt ggattggttt gcccgtctat gggaaataga gcagaaagaa 480
tactggggat acattacaaa tggtggcaca gaaggcaatc ttcatggaat cctggttgga 540
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tatttgaaag accgccttag ggaagcaggt attagtgcca tgctaaatga gcttagtagc 1200
acggttgtgt ttgagcgacc tctagatgag gagtttgttc ggcgttggca acttgcatgc 1260
gagggaaata tggcacatgt tattgtgatg cctaatgtca ccattgagaa gctggatgaa 1320
ttcttgaatg aattagttca aaagcgcgcg aattggtaca acgatgggaa agctggacct 1380
ccttgtcttg caccagatat aggaagtgag aattgtgatt gtgatcttca taaatga 1437
<210> 2
<211> 478
<212> PRT
<213> 茶樹
<400> 2
Met Glu Gly Thr Val Ser Val Leu Ser Asn Val Ser Lys Val Glu Leu Leu Ser Lys Cys
1 5 10 15 20
Phe Asp Leu Ile Thr Ile Pro Val Glu Pro Leu Pro Pro Val Val Ala Ser Asn Gly Val
25 30 35 40
Ala Gly Gly Glu Thr Lys Lys Met Lys Glu Lys Asp Ile Val Leu Gly Lys Asn Val His
45 50 55 60
Thr Thr Ser Leu Thr Ile Thr Glu Pro Asp Val Asp Asp Asp Ser Thr Ser Asp Met Glu
65 70 75 80
Ala Phe Met Ala Gly Val Leu Val Arg Tyr Arg Lys Thr Leu Ile Glu Lys Thr Lys Tyr
85 90 95 100
His Leu Gly Tyr Pro Phe Asn Leu Asp Leu Asp Tyr Gly Pro Leu Ala Glu Leu Gln His
105 110 115 120
Phe Ala Ile Asn Asn Leu Gly Asp Pro Phe Ile Glu Ser Asn Tyr Gly Val His Ser Arg
125 130 135 140
Gln Phe Glu Val Gly Val Leu Asp Trp Phe Ala Arg Leu Trp Glu Ile Glu Gln Lys Glu
145 150 155 160
Tyr Trp Gly Tyr Ile Thr Asn Gly Gly Thr Glu Gly Asn Leu His Gly Ile Leu Val Gly
165 170 175 180
Arg Glu Val Phe Pro Asp Gly Ile Phe Tyr Thr Ser Gln Glu Ser His Tyr Ser Ile Phe
185 190 195 200
Lys Ala Ala Arg Met Tyr Arg Met Glu Cys Val Lys Val Gly Thr Leu Ile Asn Gly Glu
205 210 215 220
Ile Asp Cys Ala Asp Phe Lys Ala Lys Leu Leu Ser Asn Lys Asp Lys Pro Ala Ile Ile
225 230 235 240
Asn Leu Asn Ile Gly Thr Thr Val Lys Gly Ala Val Asp Asp Ile Asp Leu Val Ile Gln
245 250 255 260
Thr Leu Glu Glu Cys Gly Phe Ser His Asp Arg Phe Tyr Ile His Cys Asp Gly Ala Leu
265 270 275 280
Phe Gly Phe Met Met Pro Phe Leu Asn Arg Gly Pro Lys Ile Thr Phe Lys Lys Pro Ile
285 290 295 300
Gly Ser Val Ser Val Ser Gly His Lys Phe Met Gly Cys Pro Thr Pro Cys Gly Val Gln
305 310 315 320
Ile Thr Arg Leu Glu His Ile Asn Ala Leu Ser Arg Asn Val Glu Tyr Leu Ala Ser Arg
325 330 335 340
Asp Ala Thr Ile Thr Gly Ser Arg Asn Gly His Ser Pro Ile Ile Leu Trp Tyr Ala Leu
345 350 355 360
Asn Arg Lys Gly Phe Lys Gly Phe Gln Lys Glu Val Gln Lys Cys Leu Arg Asn Ala His
365 370 375 380
Tyr Leu Lys Asp Arg Leu Arg Glu Ala Gly Ile Ser Ala Met Leu Asn Glu Leu Ser Ser
385 390 395 400
Thr Val Val Phe Glu Arg Pro Leu Asp Glu Glu Phe Val Arg Arg Trp Gln Leu Ala Cys
405 410 415 420
Glu Gly Asn Met Ala His Val Ile Val Met Pro Asn Val Thr Ile Glu Lys Leu Asp Glu
425 430 435 440
Phe Leu Asn Glu Leu Val Gln Lys Arg Ala Asn Trp Tyr Asn Asp Gly Lys Ala Gly Pro
445 450 455 460
Pro Cys Leu Ala Pro Asp Ile Gly Ser Glu Asn Cys Asp Cys Asp Leu His Lys
465 470 475